A Biblioteca Setorial do Nupélia é um órgão suplementar vinculado administrativamente ao Nupélia e tecnicamente à Biblioteca Central da UEM, caracterizada como universitária especializada e de livre acesso. Seu principal objetivo é a conexão e interatividade com a comunidade através da disseminação analítica do conhecimento e da informação, possibilitando a formação de idéias, pautada no composto de organização social e de prestação de serviços. Sua missão é consolidar-se como centro de referência nas áreas de Limnologia, Ictiologia, Aquicultura e suas interfaces, apoiar as atividades de ensino e o desenvolvimento da pesquisa científica.